การเดินทางทางอากาศจะลงที่ ท่าอากาศยานวาตส์ลัฟ ฮาแวล ซึ่งอยู่ห่างจากใจกลางเมืองประมาณสิบเจ็ดกิโลเมตร รถไฟระหว่างประเทศจะเข้าจอดที่ สถานีรถไฟกลางปราก รวมถึงสถานี Holešovice, Smíchov และ Masarykovo nádraží ส่วนรถบัสระหว่างเมืองจะจอดที่สถานีขนส่งหลัก Florenc, Černý Most และ Roztyly
การเดินทางภายในปรากครอบคลุมด้วยรถไฟใต้ดินสามสาย รถประจำทาง เรือข้ามฟาก และโครงข่ายรถรางที่ทั่วถึง รถรางสายยี่สิบสองได้รับความนิยมอย่างมากเนื่องจากวิ่งผ่านสถานที่สำคัญทางประวัติศาสตร์หลายแห่ง รวมถึงรถรางย้อนยุคสายยี่สิบสามและสี่สิบเอ็ด นอกจากนี้ยังมีรถกระเช้าขึ้นสู่เนินเขาเปตริน ซึ่งสามารถใช้ตั๋วเดินทางทั่วไปขึ้นได้ทันที
ระบบขนส่งในปรากใช้ตั๋วร่วมกันทุกประเภท มีทั้งตั๋วแบบสามสิบนาที เก้าสิบนาที ยี่สิบสี่ชั่วโมง และเจ็ดสิบสองชั่วโมง สามารถซื้อได้จากตู้จำหน่ายตั๋ว ร้านยาสูบ หรือผ่านแอปพลิเคชันมือถือ Lítačka ตั๋วกระดาษต้องตอกบัตรที่เครื่องตรวจเมื่อเริ่มใช้งาน ส่วนตั๋วอิเล็กทรอนิกส์ต้องเปิดใช้งานล่วงหน้า มิฉะนั้นอาจถูกปรับแปดร้อยคราวน์ การเช่ารถขับเที่ยวในเมืองไม่จำเป็นเลย เนื่องจากระบบขนส่งสาธารณะยอดเยี่ยมมากและที่จอดรถส่วนใหญ่มีค่าบริการสูง